在个体识别中,SNP(单核苷酸多态性)和 STR(短串联重复序列)是两种常见的遗传标记技术,它们各自具有不同的特点和优势。
稳定性和突变率
SNP 的突变率较低,比 STR 更为稳定。STR 序列的突变率高于人类基因的平均突变率,而且存在多个核心序列重复、核心序列的非整倍重复等现象,而 SNP 则没有这些现象。
检测位点数量
SNP 的检测位点数量远多于 STR。市面上常见的 STR 检测多为 16~50 个位点不等,而 SNP 的检测位点则为 ≥5000 个。这使得 SNP 在个体识别中能够提供更全面的遗传信息。
应用范围
STR 检测基于片段长度变异,适用于高特异性识别,如亲子鉴定;而 SNP 检测基于单个核苷酸变异,适用于广泛的基因组研究和遗传背景分析。此外,SNP 在法医亲缘关系鉴定及降解检材分析上更具优势。
样本要求
SNP 的检测对样本的要求低,由于 SNP 仅涉及单碱基的变化,一般扩增 100bp 的长度即可进行检测,所以对于一些严重降解的 DNA 样本,通过 STR 技术可能难以实现身份识别,而通过 SNP 检测则可以很容易地完成身份识别。
法医学应用
在法医学中,SNP 和 STR 都可以用于个体识别。当犯罪现场提取的物证为降解检材时,SNP 分型结果可作为补充鉴定应用于个体识别,即通过比较案发现场收集到的法医物证检材与嫌疑人的 SNP 遗传标记,判断前后两次或多次出现的个体是否为同一个体。
结论
总体而言,SNP 和 STR 在个体识别中各有优势。SNP 由于其低突变率、高检测位点数量和对样本要求低的特点,在法医亲缘关系鉴定及降解检材分析中更具优势。而 STR 则因其高特异性识别能力,在亲子鉴定等领域应用广泛。因此,在选择个体识别技术时,应根据具体应用场景和样本条件综合考虑。